¿Qué es el Análisis de Correspondencias Canónicas?
El análisis de correspondencias Canónicas (ACC) relaciona la composición de la comunidad con
base a la variación del medio ambiente. De esta manera, la variación de la
comunidad puede estar directamente relacionada con el medio ambiente. Se maneja por medio de dos matrices de datos una contiene datos de abundancia de
especies, frecuencias por lo regular y la otra contiene datos acerca de
parámetros ambientales por lo regular. 
Ejemplos
Salek et al registaron datos de 37 especies de aves donde se estudiaron los ensamblajes de aves usando una cuadrícula de puntos equidistantes colocados sobre un área seleccionada de bosque montano, que representa una mezcla de rodales dominados por piceas y dominados por hayas. Tomado en cuenta variables como altitud, pendiente, densidad del bosque, cobertura y naturaleza de la capa de arbustos, y otras características
Ahora se abre el archivo que contiene los datos, se selecciona en dos partes:
1era parte contiene los datos de especies
2da parte contiene los datos de los parámetros externos ( ambientales)
Se procede a cargarlos en la consola de R, primero la sección de especies y posteriormente de la de parámetros externos
Ejemplo1 <- cca(Especies,ParamtrosF)
Se procede a dar enter una vez escrito este comando, se debe escribir el nombre que se aigno al analisis, en este caso "Ejemplo1" se da enter y automáticamente se despliega el analisis correspondiente.
Ahora bien, para observar el resumen de el analisis solicitado, se inttriduce el comando
> summary(Ejemplo1)
Por ultimo se introduce el comando para que se genere el plano
> plot(Ejemplo1)
Aquí se puede observar el plano generado en vegan para el Análisis de Correspondencias Canónicas
Archivos de datos
Datos ejemplo 1 Salek et al. Variation in forest bird assemblages Descargar Datos ejemplo1
Antes de copiar los datos de la planilla excel a vegan recordar verificar que todos los números decimales estén escritos con puntos y no con comas.
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